Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTTNBP2NLQ9P2B4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms