Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTN3Q9P232 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTN3Q9P232 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms