Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHRF1Q9P1Y6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHRF1Q9P1Y6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PHRF1Q9P1Y6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms