Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EHD3Q9NZN3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EHD3Q9NZN3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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