Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GGA3Q9NZ52 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA3Q9NZ52 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms