Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDND1Q9NY35 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDND1Q9NY35 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms