Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BSDC1Q9NW68 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BSDC1Q9NW68 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms