Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM30AQ9NV96 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms