Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
IMP3Q9NV31 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IMP3Q9NV31 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms