Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
RRP7BPQ9NSQ0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RRP7BPQ9NSQ0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms