Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUOX1Q9NRD9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms