Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARHGEF3Q9NR81 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF3Q9NR81 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms