Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SAR1AQ9NR31 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAR1AQ9NR31 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms