Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RAB9BQ9NP90 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB9BQ9NP90 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms