Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB6Q9NP58 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB6Q9NP58 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms