Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPJQ9HC77 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPJQ9HC77 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms