Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF408Q9H9D4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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