Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf88Q9H8K7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf88Q9H8K7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms