Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7T0

CATSPERB, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPERBQ9H7T0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CATSPERBQ9H7T0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms