Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM39BQ9GZU3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms