Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL4Q9C0H6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms