Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASXL3Q9C0F0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ASXL3Q9C0F0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms