Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE2OQ9C0C9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2OQ9C0C9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms