Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM6SF1Q9BZW5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM6SF1Q9BZW5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms