Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFIH1Q9BYX4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms