Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIM54Q9BYV2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRIM54Q9BYV2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM54Q9BYV2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms