Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC3Q9BY71 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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LRRC3Q9BY71 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC3Q9BY71 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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