Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABARAPL3Q9BY60 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms