Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1QTNF1Q9BXJ1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF1Q9BXJ1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms