Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL3Q9BXA9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms