Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAIPQ9BWF2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAIPQ9BWF2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms