Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
IFT27Q9BW83 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms