Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TINF2Q9BSI4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TINF2Q9BSI4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms