Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRQ99707 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRQ99707 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRQ99707 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRQ99707 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRQ99707 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRQ99707 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRQ99707 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRQ99707 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRQ99707 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRQ99707 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRQ99707 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRQ99707 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRQ99707 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRQ99707 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRQ99707 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRQ99707 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRQ99707 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRQ99707 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRQ99707 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRQ99707 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRQ99707 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRQ99707 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRQ99707 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRQ99707 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRQ99707 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRQ99707 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRQ99707 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRQ99707 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRQ99707 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRQ99707 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRQ99707 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRQ99707 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRQ99707 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRQ99707 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTRQ99707 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MTRQ99707 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTRQ99707 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTRQ99707 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTRQ99707 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTRQ99707 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTRQ99707 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MTRQ99707 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTRQ99707 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTRQ99707 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTRQ99707 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRQ99707 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRQ99707 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRQ99707 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRQ99707 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRQ99707 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRQ99707 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRQ99707 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRQ99707 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRQ99707 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRQ99707 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRQ99707 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRQ99707 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRQ99707 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRQ99707 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRQ99707 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRQ99707 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRQ99707 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRQ99707 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRQ99707 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRQ99707 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRQ99707 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRQ99707 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRQ99707 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRQ99707 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRQ99707 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRQ99707 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRQ99707 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRQ99707 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRQ99707 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRQ99707 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRQ99707 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRQ99707 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRQ99707 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRQ99707 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRQ99707 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRQ99707 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRQ99707 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRQ99707 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRQ99707 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRQ99707 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRQ99707 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRQ99707 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRQ99707 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRQ99707 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRQ99707 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRQ99707 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRQ99707 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRQ99707 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms