Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POP1Q99575 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POP1Q99575 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP1Q99575 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP1Q99575 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP1Q99575 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP1Q99575 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP1Q99575 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP1Q99575 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP1Q99575 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP1Q99575 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP1Q99575 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP1Q99575 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POP1Q99575 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP1Q99575 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP1Q99575 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP1Q99575 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP1Q99575 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP1Q99575 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POP1Q99575 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP1Q99575 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP1Q99575 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP1Q99575 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP1Q99575 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP1Q99575 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP1Q99575 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP1Q99575 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP1Q99575 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP1Q99575 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP1Q99575 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP1Q99575 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP1Q99575 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP1Q99575 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP1Q99575 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP1Q99575 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP1Q99575 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP1Q99575 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP1Q99575 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POP1Q99575 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POP1Q99575 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POP1Q99575 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POP1Q99575 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POP1Q99575 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POP1Q99575 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POP1Q99575 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POP1Q99575 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POP1Q99575 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
POP1Q99575 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
POP1Q99575 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POP1Q99575 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POP1Q99575 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP1Q99575 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP1Q99575 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP1Q99575 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP1Q99575 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP1Q99575 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP1Q99575 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POP1Q99575 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP1Q99575 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POP1Q99575 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP1Q99575 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POP1Q99575 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP1Q99575 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP1Q99575 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP1Q99575 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POP1Q99575 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP1Q99575 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP1Q99575 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP1Q99575 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP1Q99575 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP1Q99575 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP1Q99575 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP1Q99575 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP1Q99575 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP1Q99575 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP1Q99575 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POP1Q99575 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POP1Q99575 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POP1Q99575 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POP1Q99575 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POP1Q99575 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POP1Q99575 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POP1Q99575 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POP1Q99575 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POP1Q99575 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POP1Q99575 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POP1Q99575 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POP1Q99575 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POP1Q99575 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POP1Q99575 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POP1Q99575 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POP1Q99575 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms