Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KC1Q96S38 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms