Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CRAMP1Q96RY5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CRAMP1Q96RY5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms