Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCNX1Q96RV3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PCNX1Q96RV3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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