Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CICQ96RK0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CICQ96RK0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms