Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HHIPQ96QV1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms