Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ALS2Q96Q42 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALS2Q96Q42 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms