Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LMTK3Q96Q04 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
LMTK3Q96Q04 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMTK3Q96Q04 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms