Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEUROD6Q96NK8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEUROD6Q96NK8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms