Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CMTM3Q96MX0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMTM3Q96MX0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms