Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf72Q96LT7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms