Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALPK3Q96L96 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms