Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUSD3Q96L08 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms