Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC12Q96J65 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC12Q96J65 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms