Protein–RNA interactions for Protein: Q96GN5

CDCA7L, Cell division cycle-associated 7-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7LQ96GN5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDCA7LQ96GN5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA7LQ96GN5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms