Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM11Q96F44 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM11Q96F44 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM11Q96F44 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM11Q96F44 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM11Q96F44 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM11Q96F44 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM11Q96F44 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM11Q96F44 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM11Q96F44 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM11Q96F44 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM11Q96F44 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM11Q96F44 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms